CorpoGen es un instituto de investigación colombiano que promueve la ciencia y la biotecnología en el país. Fue fundada en 1999 y tiene su sede en Bogotá. Este grupo realiza investigación básica y aplicada en microbiología, con proyectos nacionales e internacionales. Sus líneas de investigación se distribuyen en microbiología ambiental e industrial, bioinformática, bioprospección e investigación de vacunas, biorremediación. El instituto tiene un fuerte enfoque en la investigación aplicada y ha desarrollado varios productos y servicios que son utilizados por empresas y agencias gubernamentales en Colombia. La investigación de CorpoGen tiene varios beneficios para Colombia, incluida la mejora de la salud de los colombianos, la reducción de la dependencia del país de productos importados, la creación de empleos y el impulso de la economía colombiana.

1) Illumina Miseq (15 Gb x 25 millones de reads usando 2 x 300 pair ends) todo depende de la profundidad de secuenciación.

2) Nanopore minion: (depende de la celda que Corpogen adquiera pero generalmente se puede de 5 a 8 genomas completos de actinobacterias.

3) Actualmente tienen un convenio de Secuenciación afuera en EEUU en una empresa que se llama Novogene.

4) 5 % de muestras procesadas en tema de RAM Tasa de ocupación 95% Miseq – 20% nanopore

1. Microorganismos estudiados en el pasado: Klebsiella pneumoniae(fagos, factores de resistencia)​
2. Metagenoma ambientales extremos (genes de resistencia a antibioticos, páramos) – rio Bogotá​
3. COVID
4. Ahora: metasub consorcio (NYC) – sistema de transporte – (MGS) – genes de resistencia a nivel ambiental en transporte público (Sistemas de transporte de Bogotá en comparación con otras ciudades en el mundo).​
5. Análisis de resistencia de Actino bacterias liquenes de paramo – con perfiles de resistencia de patógenos clínicos. ​

1. Genes de resistencia ambientales Vs. patógenos clínicos.
2. Dinámica de los perfiles de resistencia cambio a través del tiempo ==> ambientes de transporte publico vs ambientes naturales con metasub (NYC) ​

Metasub – Washington University – John Innes Center UK​